本系成立於民國58年8月。成立的宗旨有二：第一、數學是一切科學的基礎，因此工程等都與數學有密切的關係。第二、由於電子計算機科學的萌芽，計算機科學理論與實務的發展與應用數學有極密切的關聯。當時為了配合國家培育科技人才之政策，期望理論與實用能夠相結合，發揮基礎科學的效能，所以成立了應用數學系。
隨著時代變遷，台灣社會結構呈現少子化的型態，各大專院校招生將在108學年度起連續10年面臨少子化衝擊。因此，本系重新思索教育之目標與策略，以提升整體形象與重點特色，並藉由建立多元適性的入學機制，適時調整各招生入學管道之因應策略，協助社會弱勢之優秀學生就學，落實多元選才的精神。持續擴展生源之外，近年來積極舉辦系（所）及招生博覽會，亦不定期舉辦職場導師演講及企業參訪。巨量資料近年來已成為市場關注焦點，應數系將逐步轉型為以「資料分析」成為系上未來發展核心。課程規劃分為3個學群：
一、應用數學
二、大數據
三、人工智慧（AI）
教學特色
理論課程與實務課程並重，以培育「具備數理基礎之跨領域專長人才」為目標。
課程重點
本系的課程除了42個專業必修學分以外，選修課程規劃分為應用數學、大數據與人工智慧（AI）等3個學群。
一、應用數學：
向量分析、代數學、微分方程、應用數學專題、複變函數論、數學解題方法等課程。
二、大數據：
抽樣調查、財務數學、統計資料分析、統計專題、R軟體應用、大數據分析、精算數學等課程。
三、人工智慧（AI）：
作業系統、Python程式設計、機器學習、資訊安全、資料視覺化、人工智慧、演算法分析等課程。
本系學生修畢專業必修課程，及選修各學群規定的最低 30 學分後，可申請學群證書。近年來加開人工智慧、大數據分析、R軟體應用、Python程式設計及資訊安全等實務課程。
未來發展
本系逐步轉型為以「資料分析」為未來發展核心，訓練學生具備發掘、分析及解決問題的能力。畢業系友大多數是計算機工作者，其次是從事保險金融業及教學工作。
獎學金
● 普萊德獎學金：每學期獎助3名，每名10,000元
● 謝力中獎學金：每學年獎助 1 名 4,500元。
● 系友獎學金、急難救助金等。
實習與產學合作
每學年安排業師授課之外，亦辦理企業參訪及職場導師講座，藉以提供學生獲得業界諮詢，工作和業界無縫接軌。
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